Se sigue un procedimiento similar al de la bolsa de orina reutilizable. Hay que vaciarlas siempre que estén llenas a la mitad de su capacidad. No se puede concretar cada cuánto tiempo habrá que vaciarla, porque depende del tipo de bolsa y de la cantidad y la frecuencia de las micciones. El procedimiento de vaciado, hecho por la propia persona usuaria, es el siguiente:
1. Debe sentarse cerca del váter, o incluso sobre él, y depositar papel higiénico en el interior de la taza, para que no salpique.
2. Separar la bolsa de la piel con cuidado. Para hacerlo, debe presionar sobre la piel con una mano y con la otra tirar para levantar la pieza de la bolsa, separándola del estoma.
3. Una vez separada, se debe sostener con el fondo hacia arriba: Si la bolsa tiene un sistema de cierre, debe abrirlo.
4. Vaciar la bolsa en el inodoro, comprimiéndola para vaciarla por completo.
5. Limpiar bien el extremo de la bolsa, con papel higiénico o con una toallita húmeda. Aprovechar para limpiar la piel periestomal, y secar bien con presiones suaves, sin frotar.
6. Volver a unir la bolsa a la piel periestomal, reemplazando el cierre si es necesario, según las instrucciones recibidas.